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StaPH-B（州公共卫生实验室生物信息学）联盟的Docker镜像仓库，包含多种公共卫生生物信息学工具的Dockerfile及相关文件，提供集中化、易访问的Docker镜像和清晰的构建与使用文档。
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docker-builds
本仓库包含StaPH-B（州公共卫生实验室生物信息学）联盟成员使用的各种程序的Dockerfile及其他相关文件，用于构建Docker镜像。该仓库旨在提供一个集中的Docker镜像位置，方便用户访问，并提供关于容器构建方式和使用方法的清晰文档。
如果您希望贡献Docker镜像或改进现有镜像，请fork本仓库，进行修改/添加，然后提交拉取请求。如果您在使用现有镜像时遇到问题，请提交issue。我们欢迎任何形式的反馈！ 查看贡献详情
Docker用户指南
我们还创建了一份用户指南，概述了使用和开发Docker容器的方法和最佳实践。 Docker用户指南
关于Singularity？
对于许多人来说，Docker可能不是一个选项，但Singularity是。大多数Docker容器与Singularity兼容，并且可以轻松转换为Singularity格式。请参阅上面链接的用户指南，了解如何从Dockerhub下载Docker镜像以及如何使用Singularity运行它们。我们已努力确保我们的容器与Singularity兼容，但如果您发现不兼容的容器，请提交issue告知我们！
Docker镜像仓库与托管
我们将所有Docker镜像托管在两个不同的仓库，并定期在两者之间同步镜像：
- Dockerhub - [***]
- Quay.io - [***]
2020年11月，Docker开始对Dockerhub上托管的镜像实施拉取速率限制。这限制了每个时间段内的docker pull次数（例如，***用户每六小时允许100次拉取）。我们申请并获得了Docker的“开源计划”批准，这应该已移除所有staphb Docker镜像的拉取速率限制！🎉 🥳 如果您遇到诸如ERROR: toomanyrequests: Too Many Requests.或You have reached your pull rate limit. You may increase the limit by authenticating and upgrading: [***]之类的错误，请通过提交issue告知我们。
非常感谢Docker的工作人员支持我们分发和共享公共卫生生物信息学关键工具的努力。这在COVID-19全球大流行期间尤为重要，因为许多这些工具用于对SARS-CoV-2病毒以及其他重要公共卫生关注病原体进行基因组监测。
要了解有关Docker拉取速率限制和开源软件计划的更多信息，请参阅这些博客文章（1、2、3）和Docker文档（1）。
注意：在下面的表格中，我们没有提供quay.io上各种工具的单独链接，请访问上面的quay.io链接以查找我们所有的Docker镜像。
可用Docker镜像
| 软件 | 版本 | 链接 |
|---|---|---|
| ABRicate  [] |
| centroid 
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker加速体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"
常见问题
Q1:轩辕镜像免费版与专业版有什么区别？
免费版仅支持 Docker Hub 加速，不承诺可用性和速度；专业版支持更多镜像源，保证可用性和稳定速度，提供优先客服响应。
Q2:轩辕镜像免费版与专业版有分别支持哪些镜像？
免费版仅支持 docker.io；专业版支持 docker.io、gcr.io、ghcr.io、registry.k8s.io、nvcr.io、quay.io、mcr.microsoft.com、docker.elastic.co 等。
Q3:流量耗尽错误提示
当返回 402 Payment Required 错误时，表示流量已耗尽，需要充值流量包以恢复服务。
Q4:410 错误问题
通常由 Docker 版本过低导致，需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。
Q5:manifest unknown 错误
先检查 Docker 版本，版本过低则升级；版本正常则验证镜像信息是否正确。
Q6:镜像拉取成功后，如何去掉轩辕镜像域名前缀？
使用 docker tag 命令为镜像打上新标签，去掉域名前缀，使镜像名称更简洁。
轩辕镜像下载加速使用手册
探索更多轩辕镜像的使用方法，找到最适合您系统的配置方式
登录仓库拉取
通过 Docker 登录认证访问私有仓库
Linux
在 Linux 系统配置镜像加速服务
Windows/Mac
在 Docker Desktop 配置镜像加速
Docker Compose
Docker Compose 项目配置加速
K8s Containerd
Kubernetes 集群配置 Containerd
宝塔面板
在宝塔面板一键配置镜像加速
群晖
Synology 群晖 NAS 配置加速
飞牛
飞牛 fnOS 系统配置镜像加速
极空间
极空间 NAS 系统配置加速服务
爱快路由
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绿联
绿联 NAS 系统配置镜像加速
威联通
QNAP 威联通 NAS 配置加速
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Podman 容器引擎配置加速
Singularity/Apptainer
HPC 科学计算容器配置加速
其他仓库配置
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需要其他帮助？请查看我们的 常见问题 或 官方QQ群: 13763429