PEcAn

支持的标签

• 1.6.0, 1.6, 1, latest PEcAn的最新发布版本
• develop PEcAn的最新开发版本

什么是PEcAn？

PEcAn（预测生态系统分析器，详见pecanproject.org）是一个集成的生态生物信息学工具箱（Dietze et al 2013, LeBauer et al, 2013），包含：1) 科学工作流系统，用于管理海量公开可用的环境数据；2) 贝叶斯数据同化系统，用于在最先进的生态系统模型中综合这些信息。该项目的动机在于，许多关于全球变化的紧迫问题不一定受限于新数据的收集，而更多受限于我们综合现有数据的能力。本项目旨在通过开发一个易于使用的框架，以合理的方式整合多种数据源，从而提高这种综合能力。

PEcAn工作流系统使生态系统建模更具可重复性、自动化和数据操作透明度，最终让同行和公众更容易理解。它减少了建模团队之间的工作冗余，促进协作，并使模型更易于被其他研究社区使用。

PEcAn本身不是生态系统模型，它可与多种不同的生态系统模型配合使用；集成模型需要编写包装器，将输入和输出转换为PEcAn使用的标准格式。目前，PEcAn支持超过十余种生态系统模型，并且不断有新模型被添加（详见_models_文件夹获取最新列表）。

文档

查阅我们的文档获取PEcAn项目的完整文档。

快速开始

参见PEcAn的“快速开始”页面。

如何使用此镜像

此镜像包含PEcAn的Web界面，不包含任何PEcAn R包。

您可以在调试时使用此镜像：

bash
docker run -ti --rm \
     -v ${PWD}/web:/var/www/html/pecan/ \
     -v ${PWD}/docker/config.docker.php:/var/www/html/pecan/config.php \
     -p 8888:80 \
     pecan/web

这会将web文件夹挂载到Docker容器中，使您能够编辑web文件夹中的文件，并在Web界面上实时查看更改。