dfam/tetools Docker Image Overview

dfam/tetools

包含RepeatMasker、RepeatModeler和coseg的Dfam TE Tools容器，提供最小但功能齐全的安装，适用于测试或可重复性目的。

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Dfam TE Tools Docker镜像文档

镜像概述

Dfam TE Tools容器是获取最小但功能齐全的RepeatMasker和RepeatModeler安装的简便方式，额外包含coseg工具，适用于测试或可重复性研究场景。

核心功能

集成RepeatMasker工具
集成RepeatModeler工具
包含coseg工具

使用场景

建议手动安装的情况

没有安装和/或运行docker或singularity的必要系统权限
需要安装不同版本的依赖项
需要以特定方式编译依赖项
需要将RepeatMasker作为其他流程的一部分使用
需要使用AB-BLAST或Cross-Match（这两种工具可能可用于此容器，但使用不便且未经过测试）

使用方法

使用此容器最简单且推荐的方式是通过我们开发的配套包装脚本。更多详细信息请访问：<[***]>

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oldzhang

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